时空芯片Mask文件

Stereo-seq时空芯片的Mask文件保存了所有已知的CID（坐标ID）序列信息，这些序列对于映射空间位置信息至关重要。每个CID对应芯片上唯一的空间位置，使每条原位捕获的测序序列能够被精确溯源。这个空间映射对于理解细胞和组织的空间构成非常重要，能够提供有关细胞功能、相互作用及生物样本整体结构的研究信息。

每个Stereo-seq时空芯片mask文件对应一张实体芯片，分析中请务必确认使用对应一致的文件。Mask文件命名规则如下：

芯片Mask文件在哪里

访问DCS Cloud平台

STOmics时空组学使用基于云服务的平台DCS Cloud来保存和传输您的时空芯片Mask文件。您可以通过DCS Cloud平台找到并下载您的文件。

当您购买了Stereo-seq时空试剂盒，您的订单将会与一个DCS Cloud项目自动关联。只有您成功注册云平台后，才可被添加到项目中；如未注册，DCS Cloud会发送邮件给您，请按照邮件说明，在您所在区域的网站注册一个账户。如果您不确定项目所属站点和具体云片区/数据中心，或查询不到mask文件，请联系当地销售代表以获取帮助。

快捷下载（适用于MGI平台下单的时空试剂套装）

如果您是从MGI平台下单的时空试剂套装，推荐从DCS Cloud平台首页右侧的【公共资源】->【芯片Mask数据】入口进入文件下载界面。使用这个方式无需等待个人账号被添加到具体项目中，也可直接下载mask文件。

这里可以直接通过查询芯片背面的时空芯片序列号（Stereo-seq Chip SN），或者时空芯片彩盒序列号（顶盖标签中的产品货号（REF）和序列号（SN）的组合），快速下载芯片mask文件。注意使用货号+序列号查询时，中间无需空格。

常规下载（从项目中下载文件）

登录进入DCS Cloud站点后，从菜单栏或快速启动中的 【最近项目】 进入您的项目。

进入项目后默认处于 【项目概览】 部分，在侧边栏中点击 【数据管理】，所有原始数据的分析结果都可以通过 【数据管理】 访问。检索Stereo-seq时空芯片mask文件时，在文件类型栏选择“h5”。如果想要搜索指定mask文件，可以使用芯片背面或者时空芯片包装盒标签上的序列号（ID）进行查询。

常规下载的具体操作

方式 1：网页下载（阿里云 & 亚马逊云）

在阿里云或亚马逊云的项目下载文件时会有 【网页下载】 的选项。选择mask文件后，点击 【网页下载】，文件就会下载到您的设备中。

方式 2：镭速下载（时空中心）

在数据中心的项目，mask文件存储在内部服务器（如HPC）上。出于数据安全的考虑，将这些文件从内部服务器传输到公共网络需要经过DMZ缓冲区和防火墙。因此，当在数据中心，尤其是深圳数据中心，下载mask文件时，您需要先将文件从内部服务器 【传输】 至DMZ区，再通过互联网将其 【下载】 至本地资源管理器。

步骤 1：从内部服务器传输 mask文件到DMZ

步骤 2：通过镭速工具下载mask文件

镭速下载支持使用客户端下载，以及命令行下载两种方式。

当使用镭速客户端工具时，如果您未安装过客户端，网页会提示您需要先下载安装和启动客户端后，然后才能下载文件。当您安装和启动客户端后，回到下载页面，点击“下载”，镭速会开始传输文件到本地。

选择镭速命令行下载时，需要在系统中安装镭速工具，并配置好环境变量。

点击按钮生成下载命令，确定待保存的目录名称，最终下载文件到本地或集群环境。

方式 3：Ossutil工具下载（阿里云）

Ossutil是由阿里云服务提供的命令行工具，用于管理其对象存储服务（OSS）。它可以兼容Windows、Linux和macOS，适用于不同操作系统。

步骤 1：安装和准备ossutil

下载解压安装包。

步骤 2：复制粘贴自动生成的命令，并从云端下载文件

方式 4：AWS CLI工具下载（亚马逊云）

AWS命令行界面（AWS CLI） 是一个统一的工具，允许您通过命令行管理您的AWS服务。它支持多种操作系统，包括Windows、Linux和macOS。

步骤 1：安装AWS CLI

步骤 2：复制粘贴自动生成的命令，并从云端下载文件