时空组学技术的临床和应用价值

2022.04.01

Signal Transduction and Targeted Therapy [IF: 38.104]

① 概述了空间转录组技术的发明、发展历程，在ST技术发展中具有代表的有ProximID、seqFISH+、Stereo-seq、sci-Space、STARmap、Visium、Slide-seqV2、Seq-Scope；具体描述了基于不同原理的各种ST技术，如TIVA、FISSEQ、seqFISH、LCM、APEX-seq等；讨论了当下空间转录组技术面临的一些挑战和机遇。

② 总结了有关空间转录组的生物信息学工具，包括空间聚类分析、空间可变基因分析、细胞类型反卷积、提高基因表达分辨率，以及识别细胞之间通讯的方法，并给出了具有代表性的生物信息学工具的详细信息和在线资源。

③ 介绍了空间转录组技术在神经科学、胚胎发育、病理学和炎症性疾病中的应用进展，以及在临床应用中尚未解决的问题，例如人类样本的数量仍有限，临床前空间转录组图谱如何更有效地指导临床，构建和绘制空间图谱的综合分析还需要进一步标准化、自动化等。

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空间转录组技术应用过程中的工作流程

Clinical and translational values of spatial transcriptomics.

2022.04.01, DOI: 10.1038/s41392-022-00960-w

综述；时空技术，生信工具；空间转录组，scRNA-seq，生物信息学，胚胎发育，神经科学，病理学，炎症性疾病；Linlin Zhang, Dongsheng Chen, Dongli Song, Xun Xu, Xiangdong Wang; 复旦大学附属中山医院，苏州系统医学研究所，深圳华大生命科学研究院；中国

期刊·Signal Transduction and Targeted Therapy 物种·泛物种样本类型·脑，胚胎

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