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PNAS | 全球首个基于Stereo-seq构建的类器官-时空联用技术，助力精准医疗和药物开发

“类器官”是一种类似于真实器官的组织结构，它是由人体细胞、成体干细胞或多能干细胞经过体外三维（3D）培养形成的组织类似物，能够模拟真实器官的部分或全部功能。在现代生物医学研究中，“类器官”正逐渐成为疾病研究、药物开发以及再生医学的关键工具。

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Cell重磅！华大等团队取得时空算法重大突破，将全面支撑发育、疾病等研究

11月12日，华大生命科学研究院联合斯坦福大学医学院、武汉大学电子信息学院等机构在国际顶级学术期刊《细胞》（Cell）发表时空算法工具包最新研究。该国际协作团队借鉴了物理学、地理学、经济学等多个跨学科领域的数学模型，开创性开发了三维时空建模工具包Spateo，使空间转录组学技术能够精细地重构器官三维结构、系统地量化时空动态过程。该工具包的发布标志着时空组学研究迎来革新性突破，可全面支撑胚胎发育、脑科学、疾病等领域研究，为实现高精度时空生命全景观研究迈出了极为关键的一步。

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Cell | Stereo-seq助力构建全球首份多器官衰老时空图谱

北京时间2024年11月5日，中国科学院动物研究所携手华大生命科学研究院、北京基因组研究所（国家生物信息中心），在全球顶尖学术期刊《细胞》（Cell）上发表了最新研究成果，利用华大自主研发的“超广角百亿像素生命照相机”——时空组学技术Stereo-seq，构建了全球首份多器官衰老时空图谱，增强了对衰老生物学机制的理解，找到了可用于衰老预警和评估的新型生物学标志物，并为进一步探索衰老的干预策略奠定了理论基础。

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Cell Discovery | Stereo-seq助力绘制小鼠胎盘发育精细时空图谱

近日，复旦大学附属妇产科医院、浙江大学医学遗传与发育研究院和深圳华大生命科学研究院联合开展研究，在国际知名学术期刊Cell Discovery发表最新研究成果。团队利用华大自主研发的时空组学技术Stereo-seq，成功构建并解析了胚胎植入后第7.5天至第14.5天小鼠胎盘发育的时空图谱，为探索胎盘发育的关键基因和通路提供了宝贵的数据资源和重要线索。

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Cell Systems封面 | 华大去噪算法助力获取高质量时空转录组数据

2024年10月16日，北京华大生命科学研究院最新成果以封面文章形式发表于Cell Systems。该成果介绍了时空转录组去噪算法SpotGF，阐释了这套算法如何识别并过滤噪声基因，有效降低时空组数据中的噪声，并避免新的假阳性信号。

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Nature Methods | IRIS：针对空间转录组学，进行高效且精确的整合参考信息的空间区域检测

近日，来自于布朗大学的Ying Ma以及密西根大学的Xiang Zhou在Nature Methods上发表了一篇题为“Accurate and efficient integrative reference-informed spatial domain detection for spatial transcriptomics”的研究文章。该文章介绍了一种名为IRIS的计算方法，旨在通过准确和高效地检测空间域来表征空间转录组学（Spatially resolved transcriptomics，SRT）研究中的组织结构域。IRIS独特地利用单细胞RNA测序数据，以生物学上可解释的方式检测空间域，并整合多个SRT切片，同时显式考虑切片内和切片间的相关性。

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Developmental Cell封面 | Stereo-seq助力绘制水稻种胚单细胞分辨率空间转录组图谱

2024年9月9日，浙江大学樊龙江教授课题组携手华大生命科学研究院、西南大学、华南农业大学等顶尖研究团队，在期刊Developmental Cell（IF : 10.7）上以封面文章的形式，发表了题为“Spatiotemporal transcriptomic landscape of rice embryonic cells during seed germination” 的突破性研究成果。该研究创新性地运用了单细胞转录组测序技术，以及华大自主研发的时空组学技术Stereo-seq，首次绘制出水稻种胚在种子萌发过程中的单细胞分辨率空间转录组图谱，为相关领域的研究开辟了新的视角。

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收藏 | 2024年时空组学技术Stereo-seq发文大盘点

2024年，时空组学技术Stereo-seq已助力研究人员在多个权威期刊上发表了近40篇高质量的文章，包括Nature（IF:50.5）、Cancer Cell（IF:48.5）、Cell（IF:45.5）、Science（IF:44.7）等顶尖期刊，以及Nature Methods（IF:36.1）和Nature Genetics（IF:31.7）等科研方法学与遗传学重要阵地。

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Science重磅 | Stereo-seq助力绘制首个跨物种小脑空间转录组图谱

9月27日，华大生命科学研究院联合中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心（神经科学研究所）等单位在全球顶级学术期刊《科学》（Science）上发表成果，通过华大时空组学技术Stereo-seq，单细胞组学技术DNBeLab C4，构建了猕猴、狨猴和小鼠的小脑空间转录组图谱，这是首个跨物种小脑时空组学研究。

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应用领域篇 | 文章大爆发！Stereo-seq助力80余篇高水平科研成果发表

华大时空组学技术Stereo-seq已成功应用于器官发生、胚胎发育、生命演化、脑科学、肿瘤学、植物科学等多个领域，证明了其普适性。未来，时空组学技术有望应用于生命科学与临床研究的各个领域。截至2024年8月，Stereo-seq已助力科研人员在包括Cell、Nature、Science等在内的国际知名学术期刊上发表80余篇科研成果。

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