2025.01.10 内容来源:华大时空
近日,《细胞》(Cell)杂志发布了2024年度的最佳论文(Best of 2024)特辑,精选了过去一年Cell发表的论文中,最有影响力并引起广泛关注的12篇生物学研究。其中,基于时空组学技术Stereo-seq等工具发表的“首个完整人类数字3D原肠胚模型”成功入选。
再度获评Cell年度论文
2024年恰逢Cell创刊50周年。值得一提的是,早前,华大生命科学研究院团队受邀发表了Cell 50周年专题综述,系统阐述了时空组学如何帮助研究人员理解基因组、推动生物学认知和医学变革。本次精选的“Cell2024年度最佳论文”,涵盖了生命发育、疾病研究、植物研究等领域。Cell主编John W. Pham在特辑前言中指出,在过去的一年里,全世界的科学们做出了众多令人惊叹的工作,编辑部按照“最有趣”、“最有影响力”、“最受关注”的维度精选了2024年度最佳论文。
此次入选的“首个完整人类数字3D原肠胚模型”研究,由中国科学院动物研究所、中国农业大学等机构联合完成。研究人员对CS8人类胚胎进行62张的连续切片,运用Stereo-seq技术实施了高分辨率的空间转录组分析,进而三维重构了人类CS8胚胎的3D模型,并鉴定关键位置的一系列细胞亚型,并开创性地发现了CS8时期的人类胚胎尾部很可能存在一个和中部脊索类似的组织中心,为窥探人类极早期胚胎发育提供了重要窗口。华大时空组学国内首家生态合作伙伴安诺优达为该研究提供了Stereo-seq实验以及技术支持。
值得一提的是,这是华大时空组学技术Stereo-seq成果第二次入选Cell年度论文。早前,华大生命科学研究院徐讯研究员团队基于Stereo-seq技术完成的“小鼠胚胎发育高精度生命时空图谱”成果,荣获了Cell 2022中国年度论文。再度获此殊荣,不仅显示了国际学术界对华大时空组学技术Stereo-seq及其成果的高度肯定和认可,也彰显了时空组学技术的领先性,以及其在推动生命科学研究创新突破中的巨大潜力。
该文章中,研究人员利用华大自主研发的时空组学技术Stereo-seq,构建出了世界上首个小鼠器官跨时期空间基因表达图谱集。这也是首次在单细胞分辨率水平上解析空间基因表达谱,为哺乳动物发育研究提供了重要的数据参考,将助力研究人员更好地认识胚胎的成长和器官发生,也为未来的出生缺陷相关研究提供指导。点击查看该研究详细解读>>>Stereo-seq构建小鼠器官发育时空转录图谱。
除了生命发育领域,凭借“纳米级分辨率”和“厘米级全景视场”的优势,Stereo-seq也在脑科学、衰老再生、疾病研究、植物研究等领域展现了巨大的潜力,并助力研究人员在Nature、Cancer Cell、Cell、Science等顶尖期刊,以及Nature Methods和Nature Genetics等科研方法学与遗传学重要阵地发表了近100篇研究成果。
时空工具助力科研突破
工欲善其事,必先利其器。目前,依托Stereo-seq技术,华大时空组学已开发了适用于新鲜冷冻样本的时空转录组FF V1.3,适用于福尔马林固定、石蜡包埋样本的时空转录组FFPE、时空多组学解决方案时空蛋白转录组Stereo-CITE,以及创新性的时空转录组大尺寸芯片解决方案,确保研究人员在生命探索中的广度与深度。
此外,借助华大自主研发的时空显微镜Go Optical的精准定位能力、时空自动化样本处理系统Go Spatial的高效处理能力、华大智造领先业界的测序平台,以及一系列专业优化的建库试剂与数据分析工具,华大时空组学将打造一个全面、高效且易于操作的时空转录组研究平台,助力研究人员更加高效、深入的开展科学研究。
未来,华大时空组学将继续开发通用且功能强大的工具,携手生态合作伙伴共同助力广大科研工作者进行更广、更深层次的组学探索,在生长发育、生命演化、器官结构、疾病机制等研究领域取得创新突破,驱动生命科学行业加速发展。