可以。载体版本芯片可以置于恒温培养箱中进行实验,但所有实验流程均需选择同一种设备进行温控反应,不建议交叉使用恒温培养箱和PCR仪。
TRITC与CY3激发波长、发射波长接近,因此两个通道可以互相替换使用。
不建议,因为摇床不平稳,可能会影响实验结果。
此处不是停止点,建议严格按照试剂盒使用说明书操作,贴片后立即烤片,以免影响实验结果。
具体要求请参考《Stereo-seq 透化试剂套装(载体版)使用说明书》、《Stereo-seq 转录组试剂套装(载体版)使用说明书》,从组织切片至cDNA释放步骤所需仪器设备尽量在同一区域,并且需为显微镜提供暗室条件。
显微镜是否满足实验需求,需参考《STOmics®显微镜评估参考手册》进行评估确认,评估过程中有任何疑问请联系技术支持咨询。
不建议使用激光共聚焦显微镜,因为其拍照速度慢,激光能量强,易加快荧光信号衰减,导致成像效果不佳。
时空芯片实验室、显微观察室、cDNA扩增室这三个必选实验室的分布需符合时空组学实验操作流程及动线。cDNA扩增室气压为负压或处于空气流向最下方,防止PCR扩增产生的大量核酸引起气溶胶污染,扩散到其它实验室,尤其是时空芯片实验室。
规范的时空组学实验室要求安装新风系统和通风橱,因为实验中需要用到甲醇,而甲醇挥发后经呼吸道、皮肤和消化道摄入会对人体产生毒性反应,长期处在此环境下,影响实验人员身体健康。
包埋过程中需注意取材尺寸 ( 以1 cm × 1 cm芯片为例,目前要求组织块尺寸不得大于 0.9 cm x 0.9 cm x 2 cm),选择合适尺寸的包埋盒。新鲜组织离体后需在 30 min内完成包埋,操作时应在低温环境下快速进行,避免 RNA 降解。包埋前应吸干组织表面水分,避免产生冰晶,同时也要避免 OCT 中气泡的产生影响后续切片。
实验室条件下严格保证新鲜样本在离体 30 min 内进行直接包埋处理,以最大程度避免组织 RNA 降解。