三维（three dimensions，3D）重构是当前生命科学领域的一个研究热点。3D图谱可从细胞的大量转录组数据中重现细胞和分子的总体分布，助力破解器官功能、胚胎发育、癌症及同等复杂疾病机制、物种演化等研究中的未解之谜。

  

蝾螈端脑的空间单细胞转录组图谱

华大生命科学研究院王明月博士以“High-resolution 3D spatiotemporal multi-omic atlas of developing Drosophila”为主题，详细分享了果蝇胚胎和幼虫发育过程中高分辨率3D结构图谱的构建方法和数据分析过程[3]，分析了当前面临的一些挑战，并指明了扩展当前的转录组图谱以形成完整的发育3D时空转录组图谱的发展愿景。

整合不同模式的信息数据，以实现在同一具有高空间分辨率、敏感性、特异性和通量的组织中定量成像不同种类的生物分子，是构建精确的、全面的组织3D图谱所必须的。随着技术的革新与发展，有望实现生命在时间和空间维度上细胞“地图”的全面绘制，这也将大大推动我们对于生命复杂性和人类疾病的全面认知。    

参考文献

[1] Ao Chen, Sha Liao, Mengnan Cheng, et al. Spatiotemporal transcriptomic atlas of mouse organogenesis using DNA nanoball-patterned arrays[J]. Cell, 2022, 185(10): 1777-1792.e21. doi: 10.1016/j.cell.2022.04.003.

[2] Xiaoyu Wei, Sulei Fu, Hanbo Li, et al. Single-cell Stereo-seq reveals induced progenitor cells involved in axolotl brain regeneration[J]. Science, 2022, 377(6610): eabp9444. doi: 10.1126/science.abp9444. 

[3] Mingyue Wang, Qinan Hu, Tianhang Lv, et al. High-resolution 3D spatiotemporal transcriptomic maps of developing Drosophila embryos and larvae[J]. Developmental Cell, 2022, 57(10): 1271-1283.e4. doi: 10.1016/j.devcel.2022.04.006.