2024年，华大携手DCS（DNA Omics、Cell Omics、Spatial Omics）生态合作伙伴发起了“时空及单细胞大科学支持计划”，期间成功支持时空病理大科学项目24个，涵盖结直肠癌、卵巢癌、胃癌、前列腺癌、鼻咽癌、复杂疾病及泛癌等重要研究方向，涉及芯片数量约2700张；支持单细胞大科学计划项目34个，涉及样本量约30000例。
2025年，“肿瘤3D图谱创新研究和肿瘤数字化病理大科学计划”燃动开启，加码赋能生命科研取得新突破。该计划将进一步联合业内专家和DCS生态合作伙伴，共同发起旨在理解和构建肿瘤空间异质性图谱的“肿瘤3D图谱创新研究计划”及“肿瘤数字化病理大科学计划”。
其中，“肿瘤3D图谱创新研究计划”将利用Stereo-CITE/Stereo-FF技术对肿瘤新鲜样本进行肿瘤组织的3D重构，解析真实立体的肿瘤微环境特征，构建大规模肿瘤3D数据库；“肿瘤数字化病理大科学计划”将利用Stereo-FFPE技术对肿瘤的FFPE样本进行大人群队列的回顾性研究，聚焦具体的临床问题和科学研究方向。
华大自主研发的时空组学技术Stereo-seq，已在多个重大疾病研究领域取得突破性进展。目前，该技术已成功应用于直肠癌、卵巢癌、胃癌、前列腺癌、鼻咽癌等多种肿瘤，获得了一系列具有重要科学价值的研究成果，为精准医学的发展提供了强有力的技术支撑。同时利用该技术，研究人员们在组织胚胎的3D重构上也取得了重大突破，为器官发育、组织再生等前沿领域提供了创新性研究工具和系统性解决方案。
肿瘤并非均质实体，而是由遗传异质性细胞亚群、多样化的微环境成分（如免疫细胞、基质细胞、血管）构成的动态立体生态系统。如何量化肿瘤不同空间结构的生态位差异仍然是急需解决的问题。本次发起的“肿瘤3D图谱创新研究计划”，通过整合多组学数据（如空间转录组和蛋白质组等）对肿瘤进行3D重建，可精准定位肿瘤内不同区域的细胞类型、基因表达及信号通路活性差异，可直观呈现不同细胞之间的空间特征、物理接触和细胞互作。加深对肿瘤空间异质性的理解，为实现更精准的诊疗提供有力支撑。
华大自主研发的时空转录组FFPE产品方案可在同一张切片上实现H&E染色/细胞核染色和基因表达分析。采用随机引物方案不仅仅可捕获发生降解的编码和非编码RNA，还能同时实现宿主与微生物的共检测，为肿瘤研究提供了更多维度的数据来源和解析方案。
海量的肿瘤组织以FFPE样本进行保存，FFPE样本关联患者完整的治疗记录、生存数据及病理信息。通过唤醒病理科沉睡的样本库，可实现高分辨率数据与临床结局的直接对接。研究者可在大人群、大队列尺度上构建高精度肿瘤图谱，能够快速聚焦关注的科学问题，显著缩短从基础研究到临床验证的时间周期。
本次发起的“肿瘤数字化病理大科学计划”，将聚焦肿瘤的FFPE样本，运用先进的时空组学技术，系统解析肿瘤的发病机制和治疗疗效等病理特征，构建多维度的数字化病理数据库。通过整合基因组学、转录组学（编码和非编码 RNA 以及微生物 RNA）、蛋白质组学等多组学数据，结合临床病理特征，揭示肿瘤恶性进展、治疗抵抗的时空动态规律，为深入理解疾病机理、发现新型生物标志物、开发个性化精准治疗方案提供坚实的科学依据。使FFPE样本从“病理档案”升级为“多维数据载体”，推动肿瘤研究从个案分析向群体规律挖掘转变，极大加速精准医疗的临床转化进程。
肿瘤3D图谱创新研究和肿瘤数字化病理大科学大队列支持计划顶层设计
肿瘤3D图谱创新研究和肿瘤数字化病理大科学计划的开展将为肿瘤研究领域合作伙伴带来多重利好。
降低试错成本：共享标准化实验技术和数据分析流程，节省技术评估时间；
前沿技术优先权：优先试用联盟内创新技术；
专家支持网络：跨领域专家团队提供技术咨询。
构建数据格式规范和分享机制，确保数据安全和伦理合规；
构建数据库和工具库，支持数据复用，降低项目成本。
汇聚不同学科专家人才，促进交叉学科交流和合作；
化竞争为合作，减少内卷，促进融合创新；
搭建人才培养和培训体系，在实战中培养人才。
通过标准化和规模化进行成本分摊，提升效率降低成本；
通过工具、流程、数据、知识和经验的复用，降低项目成本和风险。
策划高水平杂志论文专辑，集中发表成果，提升全球可见度；
制定数据规范和国际标准，提升全球影响力；
形成专家共识和指南，联合医院和药企，推进研究成果向临床应用转化。
1.项目申请时间
即日起至2025年9月30日
2.项目报备及初审
专家学者选择感兴趣的计划提交项目牵头人申请。华大将组织业内专家组成的评审团对申请进行评估。
3.研究方案提交
项目牵头人提交的研究方案需明确阐述科学方向，构建全面且系统的项目框架，包括研究目标、方案路线、资源保障及预期成果等。
4.最终评审
评审团对研究方案进行最终评审，确保该方案符合本计划的资助范畴且具备学术前沿性和创新性。
5.签约及执行
最终通过评审的项目，由牵头人单位、生态合作伙伴和华大签定三方协议。华大将提供价格优惠的时空和单细胞试剂支持。
6.时空数据库构建
项目完成分析后，在专业学术论文投稿时将构建数据库；论文发表后数据库公开并可共享与华大平台使用者。
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