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CellBinDB：大规模多模态数据集助力细胞分割模型开发与评估

CellBinDB：大规模多模态数据集助力细胞分割模型开发与评估

高通量空间组学技术是现代分子生物学的前沿利器，有望攻克过往无法解决的生物学问题，并通过保留组织结构更好地理解细胞间相互作用。这些超高分辨率的基因表达谱包含细胞核、质或细胞间信号混合物，为单细胞信息提取带来巨大挑战。当前相对成熟的解决方案是借助含组织捕获芯片的染色影像图（如H&E, DAPI等），通过自动化的细胞分割方案拿到芯片上组织相同位置的单细胞基因表达矩阵。

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DEMO上新 | 性能卓越！时空转录组FF V1.3深入刻画组织结构空间特征

DEMO上新 | 性能卓越！时空转录组FF V1.3深入刻画组织结构空间特征

时空转录组FF V1.3在保持Stereo-seq技术“纳米级分辨率”和“厘米级全景视场”的两大优势下，通过优化时空试剂、酶、探针设计以及算法软件完成性能优化与提升。升级后，其捕获效率大幅提升，工作流程更快速简便，用户友好性显著增强，可助力研究人员轻松获得每个细胞内的更多高质量转录本数据，通过华大自主研发的CellBin 细胞分割算法精准刻画组织结构空间特征，为各种应用场景下的科学研究提供无与伦比的洞察力。

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空间蛋白组技术：照亮肿瘤微环境研究之路

空间蛋白组技术：照亮肿瘤微环境研究之路

肿瘤微环境由不同的细胞类型及其多种表型组成，这些细胞在空间上形成一个复杂的微型“生态系统”，癌细胞与其邻接或者相互作用的细胞及非细胞成分共同影响了肿瘤的生长、侵袭、转移，以及肿瘤治疗药物的疗效。然而，传统研究方法在解析这个微观世界时往往力不从心，难以获取细胞在原位的空间信息及多组学信息。空间蛋白组技术的出现则改变了这一局面。

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Nature述评 | 分子全息图的时空建模：800万细胞虚拟胚胎精细展现器官形成过程

Nature述评 | 分子全息图的时空建模：800万细胞虚拟胚胎精细展现器官形成过程

2024年11月11日，学术出版机构Springer Nature高级记者Smriti Mallapaty于Nature杂志上发表了一篇述评，该述评聚焦华大生命科学研究院、斯坦福大学医学院及武汉大学电子信息学院等机构携手研发的三维时空建模框架Spateo。

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华大一行实地参访欧易生物，共绘时空多组学发展蓝图、推动深化合作

华大一行实地参访欧易生物，共绘时空多组学发展蓝图、推动深化合作

2024年11月12日，上海欧易生物医学科技有限公司（以下简称“欧易生物”）与华大一行，在欧易生物总部进行了深入的交流和讨论，共同规划时空多组学技术的未来。

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DEMO上新 | 更高捕获！时空转录组FF V1.3“秀”出“硬实力”

DEMO上新 | 更高捕获！时空转录组FF V1.3“秀”出“硬实力”

近日，华大时空组学正式发布了时空转录组FF V1.3，该产品可同时以“纳米级分辨率”和“厘米级全景视场”实现“组织到数据”，适用于新鲜冰冻(Fresh Frozen, FF)样本。该产品目前适配1 cm*1 cm以及0.5 cm*0.5 cm芯片，两种尺寸均可兼容同片ssDNA染色/H&E染色及单细胞分割。未来将兼容更多尺寸芯片以及多组学应用方案，满足研究人员的多样化需求。

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实测 | 伯豪生物首批时空转录组FF V1.3内测数据新鲜出炉

实测 | 伯豪生物首批时空转录组FF V1.3内测数据新鲜出炉

内测样本类型我们选取了小鼠脑组织，使用华大时空转录组FF V1.3中1 cm*1 cm芯片。结果显示，在时空转录组FF V1.3优化时空试剂、酶、探针以及算法软件后，实验结果整体数据结果非常漂亮。在1,870,628,731个Reads的测序深度下，Bin20 （约10 μm，近似单个细胞直径）平均MID为745，平均基因数达到了487，检测到的基因总数为43,114。可以看出，升级后的每个细胞内检测出了更多高质量转录本数据，为各种应用场景下的科学研究提供了无限可能。

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正式发布 | 时空转录组FF V1.3：提质增效，实现更高捕获与更精细空间探索

正式发布 | 时空转录组FF V1.3：提质增效，实现更高捕获与更精细空间探索

近日，“探索无限可能，共绘时空前沿——2024时空组学用户峰会·北京站” 圆满落幕。华大生命科学研究院主任科学家廖莎在本次会议上正式发布了适用于新鲜冷冻（Fresh Frozen, FF）样本的时空转录组FF V1.3。

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Stereo-seq细胞分割CellBin，精准单细胞研究利器

Stereo-seq细胞分割CellBin，精准单细胞研究利器

时空组学（spatial omics）可以在连续的空间维度对组织和细胞探测生命体多组学的表达和调控特征，近些年来发展迅速，且应用广泛。其中，华大发布的Stereo-seq技术同时具有“纳米级分辨率”和“厘米级全景视场”的优势，可以助力构建生命科学各类器官和组织的空间图谱、挖掘生物体发育和再生的时空景观、揭示疾病发生发展过程中的分子机制等。截至2024年9月，利用Stereo-seq技术发表的研究性论文83篇，综述23篇，预印61篇。

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产品方案篇 | 定制你的科研利器，总有一款适合你

产品方案篇 | 定制你的科研利器，总有一款适合你

目前，依托先进的时空组学技术Stereo-seq，我们已推出四款产品（解决）方案，不仅覆盖了时空转录组学和时空多组学策略，还创新性地提出了时空转录组大尺寸芯片解决方案，确保研究的广度与深度。无论您的研究样本是新鲜冷冻（Fresh Frozen，FF）样本还是经过福尔马林固定、石蜡包埋（Formalin-fixed Paraffin-embedded，FFPE）处理的珍贵组织，我们都能提供适配的解决方案。

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