Stereo-seq试剂套装_时空转录组大尺寸芯片解决方案_时空组学产品_STOmics

时空转录组FF V1.3产品用户指引时空转录组FF V1.3产品方案宣传折页 Stereo-seq 透化试剂套装 V1.1（载体版）使用说明书 Stereo-seq 转录组试剂套装 V1.3（载体版）使用说明书

卓越的捕获性能，精细化的空间探索能力

时空转录组FF产品方案是同时以“纳米级分辨率”和“厘米级全景视场”实现“组织到数据 ”的整体解决方案。该方案利用带有空间坐标信息的含有Poly T的捕获探针，实现新鲜冷冻(Fresh Frozen, FF)样本组织细胞内的mRNA分子原位捕获，并通过空间条形码（Coordinate ID，CID）还原回空间位置，实现组织空间检测。

时空转录组FF最新版本为V1.3。其凭借卓越的捕获性能，通过快速简便的工作流程，可捕获到高水平基因数，轻松实现Cellbin分析；结合强大易用的分析工具，精细探索细胞基因表达时空规律。此外，用户可灵活选择同片细胞核或H&E染色，满足多样化的研究需求。

产品亮点

捕获基因数显著提升

以500 nm级分辨率实现无偏全转录组原位捕获，并凭借卓越的捕获性能，每个细胞可获得高水平的基因数，轻松实现Cellbin分析，精细解析基因表达空间特征。

兼容性高

适用于全物种新鲜冷冻样本以及RIN值较低的珍贵样本；目前兼容1 cm × 1 cm和0.5 cm × 0.5 cm芯片；此外，还支持灵活选择同片细胞核或H&E染色。

工作流程快速简便

试剂预混，试剂盒组分减少，操作简单流畅，1天即可获得纯化后的cDNA产物，高效获得无可比拟的空间转录组数据。

分析工具强大易用

数据分析工具安装配置和操作使用简单便捷，交互友好性强，可视化能力丰富，可兼容所有第三方分割算法的结果。

应用创新

演示数据

小鼠卵巢

样本类型：FF
染色方案：H&E 染色
芯片尺寸：0.5 cm × 0.5 cm
组织切片/组织面积：3.27 mm²
每个细胞基因中位数：654
每个细胞MID中位数：1041

>>>小鼠卵巢演示数据芯片号为 B04372C211

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小鼠脑

样本类型：FF
染色方案：H&E 染色
芯片尺寸：1 cm × 1 cm
组织切片/组织面积：52.09 mm²
每个细胞基因中位数：735
每个细胞MID中位数：1223

>>>小鼠脑演示数据芯片号为 C04042E3

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小鼠眼球

样本类型：FF
染色方案：H&E 染色
芯片尺寸：0.5 cm × 0.5 cm
组织切片/组织面积：2.64 mm²
每个细胞基因中位数：586
每个细胞MID中位数：1035

>>>小鼠眼球演示数据芯片号为 C04687E314

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小鼠脑

样本类型：FF
染色方案：ssDNA 染色
芯片尺寸：1 cm × 1 cm
组织切片/组织面积：50.95 mm²
每个细胞基因中位数：698
每个细胞MID中位数：1051

>>>小鼠脑演示数据芯片号为 C04042E2

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小鼠舌

样本类型：FF
染色方案：H&E 染色
芯片尺寸：0.5 cm × 0.5 cm
组织切片/组织面积：6.22 mm²
每个细胞基因中位数：916
每个细胞MID中位数：1698

>>>小鼠舌演示数据芯片号为 B04372C214

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操作流程

应用探索

以单细胞分辨率解析 CRC 中的肿瘤微环境。在CRC组织中，利用Cellbin分析揭示了复杂的解剖结构和细胞组成，并对其细胞间通讯进行了探索。

应用探索

精确的空间单细胞分析可实现明确的组织分层。在小鼠舌组织中，可以看到上皮细胞的聚类和分层非常清晰，并符合预期的解剖结构特征。

应用探索

深入探究伴导管分化食管癌的空间分子特征，并精准定位细胞类型空间分布。病理诊断为食管溃疡性低分化鳞形细胞癌，空间转录组学结果提示存在伴导管分化腺鳞癌的可能性，这一发现可能会为伴导管分化食管癌的病因学研究及诊断治疗提供新的研究思路。

应用探索

在小鼠脑组织中，精准识别细胞类型及其空间分布。可以看到，Cellbin水平的皮层分层更明显、更符合Allen脑区分布。

产品订购信息

常见问答

Q Stereo-seq建库试剂盒（货号：101KL114）还可以用于时空转录组FF V1.3的文库构建吗？展开收起

不可以。请使用产品名称为：Stereo-seq 16 Barcode建库试剂盒、产品货号为：101KL160的建库试剂盒进行时空转录组FF V1.3文库的构建。

Q 时空转录组FF V1.3使用的测序试剂盒还和原来一样吗？展开收起

不一样。时空转录组FF V1.3兼容的测序试剂盒为DNBSEQ-T7RS 时空可视化试剂套装(T7 STO FCL PE75) 货号：940-001895-00或MGISEQ-2000RS 时空可视化试剂套装（G400 STO FCL PE75）货号：940-001887-00，测序策略为50+100+10。

Q 时空转录组FF V1.3匹配的分析软件版本号分别是什么？展开收起

时空转录组FF V1.3匹配的分析软件版本号分别为：SAW≥V8.1，StereoMap≥4.1。需注意的是，ImageStudio已合并入StereoMap软件。

Q 时空转录组FF V1.3文库和时空转录组FFPE文库是否可以在同一张T7芯片进行混测？展开收起

不可以。因为两种文库的文库结构不同，所以无法进行混测。

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