2025.04.03
福尔马林固定石蜡包埋(Formalin Fixed Paraffin Embedded,简称FFPE)的组织样本,因其易于长期稳定保存、且能够较好地维持组织形态便于在显微镜下检查和分析的特点,被广泛应用于病理学研究和临床诊断。然而,由于FFPE样本的脆弱性,在送样过程中容易出现保存不佳、运输不当等问题,从而影响后续实验结果的准确性和可靠性。为了确保样本的完整性和活性,我们特推出送样指南,助您顺利开启实验成功之门。
目前,华大时空转录组FFPE产品可接收三种样本类型,分别为FFPE蜡块、蜡片(石蜡切片)及组织贴芯片样本。
时空转录组FFPE 样本质检要求: ▶ 为保证样本质量,降低实验风险,建议切取3-5片5 μm厚的组织切片,放入1.5 mL EP管中进行Total RNA的提取和质量检测。建议对DV200 ≥ 30%的组织样本进行后续实验操作。 ▶ 蜡片样本需同步寄送蜡片和蜡卷,蜡卷用于质检,蜡片用于正式实验。 ▶ 组织贴芯片样本在贴片前要完成质检及区域选择。 FFPE 蜡块样本要求 01 蜡块质量要求 蜡块制作可参考各医院病理科制作蜡块的流程,要求脱水充分、浸蜡充分,切片可连续成片、无裂痕和空腔(组织本身自带除外),样本切片过程中不会与外部包埋的蜡分离。质检通过的蜡块务必固定在石蜡的包埋盒内,方便后续切片。 对于1 cm×1 cm的Stereo-seq芯片N,组织尺寸不应超过0.9 cm×0.9 cm×2 cm。 02 保存及运输要求 ▶ 保存条件:蜡块存放于室温或 4~8℃。 ▶ 运输条件:蜡块放入密封袋中密封,并将其放入含有冰袋的泡沫盒中寄送,保持低温2~8°C运输。运输时,做好样本防撞措施,可采用泡沫、发泡纸等多层包裹以避免运送过程中碰撞影响样本。 若蜡块不方便提供,如无法取出病理实验室,可按照要求提供蜡片或组织贴芯片样本。
FFPE蜡片(石蜡切片)样本要求
01 蜡片质量要求 选取的蜡片需平展,不能褶皱过多、破碎。要能顺利展片,无需修片,如无把握,可用邻片在蜡片运输前展片测试,若不能成功展片,不建议寄送此蜡片。 使用小毛刷或镊子将单张蜡片放入全新的50 mL 离心管中并盖紧管盖,在50 mL 离心管外标签处标记好样本名称和日期。 同时切取几个蜡卷放入单独的离心管中,做好标记,同步寄送给接收方用于质检。 对于用于实验的蜡片务必为单张蜡片,每片蜡片单独放一个离心管。
FFPE 蜡片选片标准
单张蜡片置于50mL离心管示例
提示: ▶ 普通组织建议5 μm、脂肪含量高的组织(如乳腺组织)建议4 μm; ▶ 如需保留相邻切片用于H&E染色,则可连续切3片,做好每片标记后用于后续实验。 02 保存及运输要求 ▶ 保存条件:将50 mL离心管装入自封袋并放入干燥剂密封保存,4℃冰箱密封短暂保存。预防发生损耗,经过质检的同一样本可一次运输3-5张蜡片。 ▶ 运输条件:将50 mL离心管装入自封袋并放入干燥剂密封保存,再将密封好的自封袋装入泡沫箱中,放入合适数量的冰袋,保持低温2~8°C运输。 请注意,蜡片短暂保存及整个运输过程的总时长不超过 1 周。
FFPE蜡片保存示例图
样本运输至接收方后,建议接收方尽快开展后续生化流程,如不方便立即开展,可在4℃冰箱密封保存,最长不超过1个月。 FFPE组织贴芯片样本
01 组织贴芯片质量要求 请注意,贴片前需完成质检及区域选择。 按照华大提供的组织贴芯片样本制备流程进行制备,建议由经验丰富的实验师操作,制备时需区分好A面(哑光面)和B面(光滑面),正对切片操作人员的一面为A面,贴于刀刃的面为B面;后续操作始终保持B面朝下,贴于液体、芯片和玻片,以防脱片。
AB面区分示例图
02 保存及运输要求 ▶ 保存条件:将烤干的Stereo-seq芯片N载体放入玻片保存盒中,盖上盖子,置于25°C或 37℃烘箱中,可存放48 hr;或将玻片保存盒装入自封袋并放入干燥剂密封保存,4℃冰箱密封短暂保存。
组织贴芯片保存示例图
▶ 运输条件:将自封袋装至硬盒中(防止被压变形),再放入泡沫箱,箱中放入合适数量的冰袋,保持低温2~8°C运输。 请注意,组织贴芯片短暂保存及整个运输过程的总时长不超过1周。
组织贴芯片运输示例图
样本运输至接收方后,建议接收方尽快开展后续生化流程,如不方便立即开展,可在4℃冰箱密封保存,最长不超过1个月。 温馨提示:FFPE三类样本制备、保存、运输的详细信息及注意事项,可移步时空官网获取(复制以下链接即可直达页面): https://cdn-newfile.stomics.tech/时空实验样本准备操作指南.pdf