时空转录组FF V1.3在保持Stereo-seq技术“纳米级分辨率”和“厘米级全景视场”的两大优势下，通过优化时空试剂、酶、探针设计以及算法软件完成性能优化与提升。升级后，其捕获效率大幅提升，工作流程更快速简便，用户友好性显著增强，可助力研究人员轻松获得每个细胞内的更多高质量转录本数据，通过华大自主研发的CellBin 细胞分割算法精准刻画组织结构空间特征，为各种应用场景下的科学研究提供无与伦比的洞察力。
目前时空转录组FF V1.3已测试包括人、小鼠等在内的30多种物种组织。上一期，我们已展示小鼠脑和卵巢的优异数据表现。本期将详细展示小鼠舌、眼球和脑组织的数据结果及应用探索，快来一起看看时空转录组FF V1.3的亮眼表现吧。
时空转录组FF V1.3精准识别小鼠舌组织空间特征
主要指标表现
不同Bin Size的基因捕获量统计结果
CellBin下的基因表达聚类和分群结果
02 小鼠舌组织中的应用探索
对小鼠舌组织DEMO数据结果进行深度解析，通过聚类结果（左图）可以看到，上皮细胞呈现为从肌底层细胞至角质层细胞逐层分化的分布，并且其分层非常清晰。同时，我们也分析了基底细胞的标记基因Krt14的空间分布特征，结果表明，Krt14的空间表达模式与基底细胞的分布模式一致，符合预期的解剖结构特征。这表明，我们利用精确的空间单细胞分析可实现明确的组织分层。
左图：小鼠舌组织中，上皮细胞呈现为从肌底层细胞至角质层细胞逐层分化的分布；中图和右图：展示了标记基因Krt14的表达模式（右图）与相关细胞（基底细胞）的分布模式（中图）一致
小鼠舌组织演示数据芯片号为B04372C214，数据下载链接（复制链接到浏览器下载）：
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时空转录组FF V1.3精细绘制小鼠眼球视网膜结构特征
主要指标表现
不同Bin Size的基因捕获量统计结果
CellBin下的基因表达聚类和分群结果
02 小鼠眼球组织中的应用探索
基于小鼠眼球中细胞精确高效捕获到的转录组数据，结合CellBin分析，我们精细绘制了小鼠眼球视网膜的空间结构特征。我们观察到，小鼠眼球marker基因的分布模式正确，差异基因的空间分布和细胞聚类分层均符合眼球视网膜结构特征。
小鼠眼球组织演示数据芯片号为C04687E314，数据下载链接（复制链接到浏览器下载）
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时空转录组FF V1.3实现小鼠脑更精确的细胞类型及空间位置识别
主要指标表现
不同Bin Size的基因捕获量统计结果
CellBin下的基因表达聚类和分群结果
02 小鼠脑组织中的应用探索
我们利用CellBin细胞分割技术精准识别小鼠脑组织细胞类型及其空间分布特征，在小鼠脑组织图中可以看到，CellBin水平的皮层分层明显（左图），符合Allen脑区分布（右图）。
小鼠脑组织演示数据芯片号为C04042E2，数据下载链接（复制链接到浏览器下载）：
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更多DEMO数据可登录时空官网（https://www.stomics.tech/）查阅下载。
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