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138条搜索结果:
Q 可否使用之前的建库试剂盒(货号:101KL114)进行建库,文库可否使用之前的测序试剂盒(货号:1000028455)进行测序? 展开 收起
A

可以用之前的建库试剂盒(货号:101KL114)进行FFPE文库构建,但是构建出来的文库需要用新版的时空可视化试剂套装(货号:940-001895-00)进行测序

Q 在进行时空转录组FFPE的解交联实验流程中,解交联试剂可以反复预热吗?解交联步骤95℃结束之后是否需要等到下一个反应温度,还是可以拿出芯片? 展开 收起
A

1、解交联试剂可以反复预热;

2、解交联步骤95℃降温后就可以拿出来,不需要等到下一个反应温度

Q 在进行时空转录组FFPE的生化流程中,如果不拍照,不需要看track线,贴片时能100%贴满芯片吗? 展开 收起
A

从技术角度是可以贴满芯片,但是如果切片全覆盖到芯片上,可能存在以下风险点:1. 可能会戳到切片的边角;2. 可能会导致影像图无法识别track线导致QC fail,配准困难。

Q 对于时空转录组FFPE 生化流程第三方物料中,试剂TE buffer(pH 9.0)可否用调试好的?能否替换为其他非推荐品牌货号试剂? 展开 收起
A

1、不建议使用直接调试好的TE buffer(pH 9.0)。

2、建议直接使用推荐的品牌货号试剂,不建议使用其他非推荐品牌。

Q 对于FFPE的样本,拍照前盖玻片封片后发现有气泡存在,可以取下盖玻片重新封片操作吗? 展开 收起
A

不能重新盖片。

Q 在进行时空转录组FFPE的生化流程中,对切片进行捞片的时候,如果没贴好能重新贴吗? 展开 收起
A

建议在漂片的时候观察组织形态,如果没有贴牢固,放回液体后切片飘起来了可以重新贴片,如果已经与芯片贴牢固,不能飘起来,就不能重新贴片了。

Q 在进行时空转录组FFPE的生化流程中,贴片后进行烤片时(42˚C烤3h后37˚C烤片过夜),PCR仪能否换为烘箱?烤片时可以盖PCR仪盖吗?烤片最少需要多久时间?是必须37℃烤片过夜吗? 展开 收起
A

1、在进行时空转录组FFPE的生化流程中,贴片后进行烤片时(42˚C烤3h后37˚C烤片过夜),PCR仪可以替换为烘箱。

2、可以盖PCR仪盖进行烤片。

3、烤片时间建议按照说明书进行操作。

Q 如果想用时空转录组检测组织样本中的微生物,是选择FF样本比较好还是用FFPE样本比较好? 展开 收起
A

对于时空转录组,目前只有FFPE试剂盒及实验流程可以兼容微生物检测。

Q 时空转录组适用于FFPE骨组织样本吗?如果对骨组织预先进行脱钙处理,对捕获结果会有什么影响? 展开 收起
A

1、骨组织是易脱片样本,即便是脱钙处理也会有脱片风险。

2、如果对骨组织预先进行脱钙处理,对捕获率会有一定程度的影响。

Q 进行时空转录组的FFPE样本,推荐的切片厚度是多少?FFPE样本的切片厚度不考虑样本本身细胞的大小吗?切片厚度从5μm下降到4μm对捕获量有影响吗? 展开 收起
A

1、对于FFPE样本的切片厚度,一般建议是5μm,但对于脂肪含量高的FFPE样本或者容易脱片的FFPE样本,建议选择4μm的切片厚度。

2、FFPE样本一般是病理组织,经过固定脱水的组织细胞会缩小,所以建议切片5μm厚度,切片厚度也可以根据老师的科研需求自行调整。

3、切片厚度对捕获影响不大,若项目执行有一致性要求可遵循同项目其他样本操作要求即可。

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