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DEMO上新 | 更高捕获！时空转录组FF V1.3“秀”出“硬实力”

2024.11.08 内容来源：华大时空

近日，华大时空组学正式发布了时空转录组FF V1.3，该产品可同时以“纳米级分辨率”和“厘米级全景视场”实现“组织到数据”，适用于新鲜冰冻(Fresh Frozen, FF)样本。该产品目前适配1 cm*1 cm以及0.5 cm*0.5 cm芯片，两种尺寸均可兼容同片ssDNA染色/H&E染色及单细胞分割。未来将兼容更多尺寸芯片以及多组学应用方案，满足研究人员的多样化需求。

时空转录组FF V1.3不仅可以应用于人和小鼠，也可对其他物种进行时空全转录组信息挖掘。目前时空转录组FF V1.3已测试包括人、小鼠等在内的30多种物种组织。本文将详细展示小鼠脑和卵巢的数据结果，让我们一起看看时空转录组FF V1.3亮眼的数据表现吧。

小鼠卵巢组织DEMO数据结果展示

微信图片_20241108093446

01 Summary

主要指标表现

测序Q30值以及注释到基因各区域的reads数

微信图片_20241108093528

测序饱和度曲线（Bin20）

02 Square Bin

微信图片_20241108093558

不同Bin Size的基因捕获量统计结果

微信图片_20241108093607

Bin20下的基因表达聚类和分群结果

*注：时空芯片上每个 DNB 在基因表达热图上表现为一个像素点，此时的分析单元为Bin1，即一个像素点只包含一个 DNB 的数据。Bin20（10 μm*10 μm）表示一个分析单元包含20×20=400个 DNB 区域的数据。

03 CellBin

01微信图片_20241108093619

CellBin数据分析结果

02微信图片_20241108093631

CellBin下的基因表达聚类和分群结果

小鼠卵巢组织演示数据芯片号为B04372C211，数据下载链接（复制链接到浏览器下载）：

http://116.6.21.110:8090/share/3b93c1a6-e88c-41dc-a6d8-6779981ddc3e

小鼠脑组织DEMO数据结果展示

微信图片_20241108093648

01 Summary

微信图片_20241108093732

主要指标表现

03微信图片_20241108095018

测序Q30值以及注释到基因各区域的reads数

04微信图片_20241108093947

测序饱和度曲线（Bin20）

02 Square Bin

不同Bin Size的基因捕获量统计结果

微信图片_20241108094006

Bin20下的基因表达聚类和分群结果

*注：时空芯片上每个 DNB 在基因表达热图上表现为一个像素点，此时的分析单元为Bin1，即一个像素点只包含一个 DNB 的数据。Bin20（10 μm*10 μm）表示一个分析单元包含20×20=400个 DNB 区域的数据。

03 CellBin

微信图片_20241108094018

CellBin数据分析结果

微信图片_20241108094027

CellBin下的基因表达聚类和分群结果

小鼠脑组织演示数据芯片号为C04042E3，数据下载链接（复制链接到浏览器下载）：

http://116.6.21.110:8090/share/7f5966d8-ca8c-482f-ac43-db5786414897

更多DEMO数据可登录时空官网（https://www.stomics.tech/）查阅下载。

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