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Current Medicine | 空间转录组学在生物医学及临床研究中的应用

2023.08.22 内容来源:华大时空

近日,华大生命科学研究院团队在《Current Medicine》在线发表了题为“Spatial transcriptomics in human biomedical research and clinical application”的综述文章。该文章针对生命科学领域当前最热门的技术——空间转录组学(ST)展开论述,探讨了其如何以时空方式跟踪疾病发生发展的机制,探寻疾病特异性生物标记物,以及对该技术未来的发展前景,为研究者在疾病研究领域更好地利用该技术提供了参考。

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文章页面截图


过去15年来,单细胞测序技术与其他多组学技术相结合,在基因组、转录组和蛋白质组水平上揭示了人类发育、肿瘤和复杂疾病等的机理。然而,这种方法无法直接反映相关的空间信息。空间转录组学技术的发展则为解决这一问题提供了契机。

 

研究表明,ST技术是解决重大生物医学和临床问题的有效工具,包括肿瘤、脑科学、胚胎发育研究、器官图谱构建以及其他复杂疾病的病理分析。研究人员推测未来ST的发展将进一步揭示疾病的时空背景,并最终推动各种疾病的新诊断和新治疗。

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ST技术发展时间表


在ST的发展过程中,各种技术相继出现。其中,华大自主研发的时空组学技术Stereo-seq,凭借纳米级分辨率和厘米级全景视场的突破性优势,已助力研究人员在宫颈鳞癌、黑色素瘤、肝癌、糖尿病等疾病研究上实现了重要突破。


综上所述,ST标志着基因组测量的新开端,有助于探索个体的动态发育和疾病过程。空间转录组学的创新将为探索人类组织结构和功能提供有力工具,拓展其在生物学之外的潜在应用。

 


*引用本文

Hu, W., Zhang, Y., Mei, J. et al. Spatial transcriptomics in human biomedical research and clinical application[J]. Current Medicine, 2023. DOI: 10.1007/s44194-023-00023-4.


华大生命科学研究院临床科研高级经理胡维宁为论文的第一作者,华大生命科学研究院方晓东研究员为该文的通讯作者。