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Cell Research | 单细胞时空转录组技术鉴定胎肝中HSC/MPP扩增单位

中国科学院动物研究所、北京大学生命科学学院和深圳华大生命科学研究院的研究人员利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间转录组（包括华大自主研发的时空组学技术Stereo-seq）联合分析，绘制了小鼠胎肝（fetal liver，FL）发育的单细胞时空转录组图谱，解析了造血干/祖细胞的转录组和功能异质性，鉴定了新型的造血干细胞扩增的功能单元（HSC ‘pocket-like’ units, HSC PLUS）并揭示了其分子机制。该文章在2021年8月发表于Cell Research，下面是详细解读。

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专题解读 | scStereo-seq揭示拟南芥叶片表征区域特异性细胞和空间转录组变化

深圳华大生命科学研究院等在自主研发的时空组学技术Stereo-seq基础上，针对植物样本具有细胞壁这一特性，建立了一套适用于植物的、单细胞化的空间转录组技术scStereo-seq（single-cell SpaTial Enhanced REsolution Omics-sequencing）。研究团队将其示范应用于模式植物拟南芥（Arabidopsis）的叶片研究中，对上、下表皮细胞、栅栏细胞、海绵细胞的转录组特征进行了详细解析，攻克了长期以来研究人员无法对叶片中高度相似细胞类型的分子特征进行有效解析的难题。该文章在2022年5月4日作为专辑文章之一发表于Developmental Cell，以下是详细解读。

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专题解读 | Stereo-seq绘制斑马鱼胚胎的时空图谱和发育轨迹

深圳华大生命科学研究院联合华中农业大学等团队，利用华大自主研发的Stereo-seq时空组学技术，结合多切片策略，在单细胞分辨率水平上，对斑马鱼受精后24 h（hpf, hour post-fertilization）以内6个关键时间点（3.3、5.25、10、12、18、24 hpf）的胚胎进行研究。研究人员首次绘制了斑马鱼胚胎早期发育的时空转录组图谱，构建了在组织空间维度上的发育轨迹。此研究能够直观地观察到，在原位组织上细胞是如何分化、迁移并发育形成各组织器官的。该文章于2022年5月4日发表在Developmental Cell，以下是文章第一作者刘畅博士的详细解读。

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专题详解 | Stereo-seq构建小鼠器官发育时空转录图谱

近日，由杭州华大生命科学研究院主导，联合广东省人民医院、武汉大学等机构共同完成的蝾螈脑再生时空图谱入选2022年度“浙江十大科技事件”。本次结果由浙江日报、浙江新闻客户端联合浙江省科协、部分...

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专题解读 | Stereo-seq高分辨率构建果蝇胚胎和幼虫的三维时空发育图谱

深圳华大生命科学研究院联合南方科技大学等单位，基于华大自主研发的高分辨率时空组学技术Stereo-seq，构建了模式生物果蝇的晚期胚胎和幼虫的3D时空发育图谱，鉴定了发育中果蝇中肠的空间亚区，解析了幼虫精巢细胞命运的转变，揭示了果蝇发育过程中潜在的空间转录因子调控网络。该文章在2022年5月4日作为专辑文章之一发表于Developmental Cell，以下是第一作者王明月博士的详细解读。

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Cell专题 | 华大Stereo-seq系列成果发布，揭秘超高分辨率生命全景时空图谱

北京时间2022年5月4日晚，国际顶级期刊Cell和子刊Developmental Cell，上线了4篇应用Stereo-seq技术的研究文章，揭示其在小鼠、斑马鱼、果蝇、拟南芥模式生物中的应用成果，其中Cell文章详细介绍了Stereo-seq技术原理和细节。此外，Cell出版社官网还特设专题网页面（https://www.cell.com/consortium/spatiotemporal-omics），展示了以上4篇文章及4篇应用Stereo-seq技术的BioRxiv预印成果，包括食蟹猴脑时空组图谱、蝾螈脑再生时空图谱、实体瘤时空组图谱等。同时，此次专题成果也是时空组学联盟（STOC）的首期重磅成果。

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Nature | 一作详解首个非人灵长类动物全身器官细胞图谱研究

近日，由深圳华大生命科学研究院主导，多国科研团队合作在Nature上发表了文章Cell transcriptomic atlas of the non-human primate Macaca fascicularis，共同绘制了首个非人灵长类动物（猕猴）全身器官细胞图谱。基于华大的DNBelab C系列高通量单细胞RNA文库制备试剂盒（DNBelab C4）和DNBSEQ测序平台，研究人员对猕猴的45个组织约114万个细胞进行单细胞测序分析，获得了世界上首个非人灵长类动物全身器官细胞图谱。该图谱将被用于物种进化、人类疾病以及药物评价和筛选相关的研究，为生物医学的发展提供基础性的资源和工具，为疾病诊疗、靶向药物开发提供助力，为人类更好地探究生命的进化提供可能。我们特邀文章第一作者、韩磊博士对该文章进行详细解读。

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华大等机构发布全球首个非人灵长类动物全细胞图谱，助力人类疾病研究

北京时间4月13日晚，由深圳华大生命科学研究院主导，多国科研团队共同参与的首个非人灵长类动物（猕猴）全身器官细胞图谱发表于国际顶级学术期刊《自然》(Nature)。该图谱将被用于物种进化、人类疾病以及药物评价和筛选相关的研究，为生物医学的发展提供基础性的资源和工具，为疾病诊疗、靶向药物开发提供助力，为人类更好地探究生命的进化提供可能。

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