StereoMap 发版说明

4.1.2 (3月, 2025)

  • 修复部分数据在图像处理第二步无法正确加载配准矩阵的问题。
  • 修复 bin 1 分辨率下表达矩阵热图在界面中无法完整展示的问题。
  • 修复 Stereo-CITE 数据在可视化模块,取消选择某个蛋白,联动窗口无法可视化标记基因的问题。
  • 修复可视化模块调整表达热图的透明度后, MID 过滤的最大值展示异常的问题。

4.1.1 (11月, 2024)

  • 为避免悬浮信息的遮挡影响 lasso 的操作,可视化 lasso 过程中,软件会默认关闭悬浮信息。
  • 可视化 bin1 热图性能优化,优化后可以更加丝滑的可视化您的数据。
  • 图像处理的手动配准矩阵默认 binsize 的大小从 bin20 修改为 bin10,满足不同数据的配准需求。
  • 图像处理第五步导出手动结果时,新增配准后 TIF 图的输出路径说明。
  • 新的适配MacOS 第一个版本发布啦。 (12月, 2024)

4.1.0 (9月, 2024)

  • 您现在可以在细胞级分辨率下直观地探索单个或选定特征的分布。
  • 对于由 SAW 8.1.0 或更高版本输出的 Stereo-CITE 数据集,您可以在联动窗口中轻松可视化蛋白质及其对应的标记基因。
  • 新的图像配准方法!通过标记特定特征点,将图像与空间特征表达矩阵对齐。这个方式无需导入矩阵,但请确保您的图像通过质量控制(QC),并且四个芯片边缘或角落可见。
  • 图像处理的关键步骤增加操作指引说明。
  • 从可视化 Visual Explore 或图像处理 Image Processing 导出文件时,系统会提示您选择保存位置和文件名。
  • Image QC 中的图像清晰度评估已取消。
  • 图像质控完成后,分析结果建议中增加 QC 后的输出文件目录,鼠标点击可以打开文件系统直接跳转到对应的文件路径。

4.0.1 (7月, 2024)

  • 修复软件部分已知BUG和问题。

4.0.0 (6月, 2024)

  • 全新的可视化(Visual Explore)、图像处理(Image Processing)、和工具(Tools)入口界面。
  • 可视化新增 SAW 输出的 .stereo 统领文件来展示可视化的分析数据。
  • 可视化新增手动标记区域,并对标记区域分组。
  • 可视化支持导出感兴趣区域用于差异分析的参数文件,在 SAW 运行差异分析。
  • 可视化支持 SAW 输出的差异分析文件 .csv 结果可视化。
  • StereoMap 新增全新设计的图像处理工具,包括:
    • 全新升级的用户界面,按照step by step 的推荐方式引导用户做图像处理。
    • 组织分割和细胞分割支持第三方工具提取的二值化.TIF图,并接回 SAW 后续分析流程,提取矩阵。
    • 新增图像的手动配准,将图像和空间表达矩阵对齐。
  • 新增 Image QC 工具,用于评估图像质量。通过 QC 的图像可以在 SAW 中进行自动分析,否则需要使用图像处理工具进行手动处理。
© 2025 STOmics Tech. All rights reserved.Modified: 2025-04-21 10:12:24

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