下载
StereoMap 4.1.2 (2025年3月)
下载过程中如果被操作系统拦截，点击“保留”，将安装包添加到信任中。
StereoMap 4.1.0~4.1.2 更新亮点
- 您现在可以在细胞级分辨率下直观地探索单个或选定特征的分布。
- 对于由 SAW 8.1.0 或更高版本输出的 Stereo-CITE 数据集，您可以在联动窗口中轻松可视化蛋白质及其对应的标记基因。
- 新的图像配准方法！通过标记特定特征点，将图像与空间特征表达矩阵对齐。这个方式无需导入矩阵，但请确保您的图像通过质量控制（QC），并且四个芯片边缘或角落可见。
- 从可视化 Visual Explore 或图像处理 Image Processing 导出文件时，系统会提示您选择保存位置和文件名。
- 为避免悬浮信息的遮挡影响 lasso 的操作，可视化 lasso 过程中，软件会默认关闭悬浮信息。
- 可视化 bin 1 热图性能优化，优化后可以更加丝滑的可视化您的数据。
- 新的适配！MacOS 第一个版本发布啦。 (12月, 2024)。
- 修复部分数据在图像处理第二步无法正确加载配准矩阵的问题。
系统要求
| 最低配置 | |
|---|---|
| Windows |
|
| MacOS |
|
性能说明
- 如果待分析的数据集（比如 100 k+ 的 cells/bins）较大时，强烈建议使用四核处理器，32GB 及以上的内存，性能方面应该会有较好的体验。
- 如果输入的数据存储在外部（例如外部硬盘）设备时，软件的性能可能会因设备的传输受到影响，包括 I/O 读写变慢或者延迟，连接意外断开等导致软件报错。
软件安装
下载.exe文件，双击可执行文件开始安装。
如果在安装的过程中遇到如下提示，您可以点击“打开”，将其添加到信任中。
选择安装路径，默认为"D:\StereoMap"，可根据需要修改目标文件夹。点击 Install 开始安装。
首次安装或者在线更新，请确保您的安装目录必须满足至少 20GB 的可用磁盘空间。
请确保安装路径中未包含其它特殊字符或者符号。当前支持的字符包括：空格、下划线、字母A~Z和数字0~9。
安装完成后，点击 Finish 即可。
相关软件（SAW）兼容
- SAW >= v8.0 （历史版本的适配兼容信息）。
- 请使用最新的 Image QC 重新QC，生成 TAR
(.tar.gz)图像文件。
设置
在线更新
点击右上角的设置
，选择 About ，联网状态下可以手动检查版本信息，如果有新版本发布，您可以选择下载并安装新的软件包。
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您也可以勾选软件开机时自动检查最新版本的选项，程序会自动检测是否有新版本的更新。
保存
设置每个模块输出文件的路径，默认是您的安装目录，您也可以根据需求更改。
显微镜信息配置
提示：建议在做图像 QC 时，保存您的显微镜配置信息方便后续使用。
设置显微镜图像的详细信息，该信息会在 QC 评估中使用到，您也可以点击 Edit/Add 按钮新增或者编辑配置信息。
您可以新增
、修改
和删除
已有的显微镜配置信息，参数说明如下：
- Config Name：显微镜配置的名称。
- Manufacturer：显微镜品牌的名称。
- Model：显微镜的型号。
- Objective：拍摄时显微镜的物镜倍率。
- Overlap：拍摄时两个相邻FOV的重叠比例。
- Scale：拍摄图像的比例，单位为μm/pixel（微米每像素）。
- FOV Width：拍摄时的一个FOV的宽度。
- FOV Height：拍摄时的一个FOV的高度。
- Set as Default: 是否设置为默认的显微镜配置。
点击 Confirm 按钮保存编辑的配置。
在图像处理的第一步中，如果输入的是TIFF大图，将会使用到已经保存的配置信息，当然您也可以在图像处理模块中访问、增加、编辑或者删除该配置信息。
