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初次接触SAW?

SAW是什么?

Stereo-seq Analysis Workflow (SAW) 是一套生信分析流程软件包,整合了多个Stereo-seq空间组基因表达分析工具。它可以将测序数据映射到组织切片上的空间位置,量化特征表达,直观地呈现空间表达分布。SAW 处理来自 Stereo-seq 测序平台的数据,结合显微镜拍照图像,生成空间特征表达矩阵。分析人员可以将SAW标准分析流程输出的文件结果作为起点,开展下游生信分析。
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SAW使用介绍

1.下载和安装

软件下载 >

安装 >

2.数据准备

输入概览 >

3.分析流程

SAW 参数命令 >

SAW count >

SAW realign >

其他辅助分析流程 >

4.运行分析

Stereo-seq FF >

Stereo-seq FFPE >

Stereo-CITE FF >

接入手动图像数据 >

5.输出结果

输出概览 >

HTML 报告 >

6.其他信息

时空词汇 >

算法原理说明 >

文件格式详解 >

GPU使用 >

© 2025 STOmics Tech. All rights reserved.Modified: 2025-03-07 10:28:04

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