概览
SAW
SAW工具是什么?
Stereo-seq Analysis Workflow (SAW) 是一套生信分析流程软件包，整合了多个Stereo-seq空间组基因表达分析工具。它可以将测序数据映射到组织切片上的空间位置，量化特征表达，直观地呈现空间表达分布。SAW 处理来自 Stereo-seq 测序平台的数据，结合显微镜拍照图像，生成空间特征表达矩阵。分析人员可以将SAW标准分析流程输出的文件结果作为起点，开展下游生信分析。
SAW: an efficient and accurate data analysis workflow for Stereo-seq spatial transcriptomics, Gigabyte, 2024 https://doi.org/10.46471/gigabyte.111
运行分析
| 输入文件 | 准备 SAW 分析的输入文件 |
| 分析流程 | 如何运行 SAW 分析流程 |
| 输出结果 | 探究 SAW 分析的输出结果 |
使用教程
| Stereo-seq FF 数据分析 | 学习如何使用 FF (fresh frozen) 样本数据开展 SAW 分析 |
| Stereo-seq FFPE 数据分析 | 学习如何使用 FFPE (formlin-fixed paraffin-embedded) 样本数据开展 SAW 分析 |
| Stereo-CITE FF 数据分析 | 学习如何使用蛋白组转录组 Stereo-CITE FF (fresh frozen) 样本数据开展SAW分析 |
| 手动图像处理 | 学习如何使用 StereoMap 输出的手动处理图像重启分析 |
©2025 深圳华大三箭齐发科技有限责任公司保留所有权利。
- 本产品仅用于研究，不用于诊断。
- 本手册上的内容可能全部或部分受到适用的知识产权法的保护。深圳华大三箭齐发科技有限责任公司和/或相应权利主体依法拥有其知识产权，包括但不限于商标权、版权等。
- 深圳华大三箭齐发科技有限责任公司不授予或暗示使用我们或任何第三方的任何版权内容或商标（注册或未注册）的权利或许可。未经本单位书面同意，任何人不得擅自使用、修改、复制、公开传播、更改、分发或发布本手册的程序或内容，不得使用或利用设计技巧使用或占有本单位或本单位关联方的商标、标识或其他专有信息（包括图像、文本、网页设计或形式）。
- 此处的任何内容都无意于或应被理解为对此处列出或描述的任何产品的性能的任何保证、表达或暗示。适用于本文所列任何产品的任何和所有保证均载于购买该产品所附的适用销售条款和条件。深圳华大三箭齐发科技有限责任公司不做任何保证，并在此声明对本文所述任何第三方产品或协议的使用不做任何保证。